Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kdm8Q9CXT6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdm8Q9CXT6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms