Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nip7Q9CXK8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms