Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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