Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms