Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ddx28Q9CWT6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx28Q9CWT6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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