Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smurf1Q9CUN6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smurf1Q9CUN6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms