Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud1Q9CUB6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otud1Q9CUB6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms