Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd1Q9CR42 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms