Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms