Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQM1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQM1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQM1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms