Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rwdd1Q9CQK7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rwdd1Q9CQK7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms