Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb9Q9CQJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms