Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpb2Q9CQI7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpb2Q9CQI7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms