Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms