Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms