Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt88Q9CPR6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms