Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe41Q99PV5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms