Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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