Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms