Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco2Q99NF1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco2Q99NF1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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