Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rims1Q99NE5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms