Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf17Q99MV7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf17Q99MV7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms