Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd1Q99MV1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd1Q99MV1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms