Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrrtQ99MR6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms