Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b4Q99ME6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms