Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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PtprtQ99M80 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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PtprtQ99M80 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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PtprtQ99M80 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PtprtQ99M80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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PtprtQ99M80 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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PtprtQ99M80 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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PtprtQ99M80 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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PtprtQ99M80 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprtQ99M80 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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PtprtQ99M80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.54■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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PtprtQ99M80 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprtQ99M80 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PtprtQ99M80 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
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