Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnps1Q99M28 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms