Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gins4Q99LZ3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms