Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nus1Q99LJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms