Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rcbtb2Q99LJ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rcbtb2Q99LJ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rcbtb2Q99LJ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rcbtb2Q99LJ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rcbtb2Q99LJ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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