Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clp1Q99LI9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clp1Q99LI9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms