Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms