Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RtcbQ99LF4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms