Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pagr1aQ99L02 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms