Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TriobpQ99KW3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms