Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms