Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep3Q99KK1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms