Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2aQ99KJ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn2aQ99KJ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms