Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Me2Q99KE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Me2Q99KE1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms