Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlgn1Q99K10 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms