Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lims1Q99JW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms