Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms