Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apobec3Q99J72 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms