Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim11aQ99J19 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim11aQ99J19 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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