Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf112Q96DY5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf112Q96DY5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms