Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csmd1Q923L3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms