Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms