Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prpf3Q922U1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf3Q922U1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms