Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf3Q920N1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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