Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx18Q91ZR2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms